More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3216 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  47.03 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  37.79 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  34.18 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  31.4 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  32.28 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 254 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.5 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  28.93 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  31.19 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>