More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2317 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  31.18 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 293 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  24.76 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  29.5 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  30.82 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  28.02 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2558  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2521  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2566  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.520739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  27.53 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0867  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  34.9 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  28.05 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>