More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2558 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2521  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2566  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.520739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2558  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 230 aa  104  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 219 aa  91.3  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  34.16 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  26.87 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  34.43 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  30.88 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.96 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.53 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  41.53 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>