More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2846 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  30.15 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.04 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 257 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  26.04 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  27.48 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  23.65 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  23.92 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1715  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  23.88 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  23.87 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>