More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6333 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  34.12 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  30.39 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  35.29 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1173  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  26.09 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.27 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  31.03 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>