More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1715 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1715  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3471  transcriptional regulator, GntR family  64 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0537  GntR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104238 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1557  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.91 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>