More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0537 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0537  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104238 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1715  GntR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 229 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3471  transcriptional regulator, GntR family  41.24 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1557  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 293 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0240  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  29.9 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.39 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  31.66 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>