More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1871 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  95.73 
 
 		 211 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 216 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  79.31 
 
 		 211 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  74.51 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  75.85 
 
 		 213 aa  258  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  48.5 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  48.76 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  37.7 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  37.88 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  42.63 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 231 aa  97.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  40.64 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  37.31 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  38.86 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 242 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 		 246 aa  94.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 254 aa  94.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  41.05 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 229 aa  92  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 258 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>