More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4210 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  43.07 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  45.51 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  44.39 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  34.13 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 260 aa  92  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 219 aa  91.7  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  34.7 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  34.7 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.94 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.63 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>