More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4721 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  98.75 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  92.09 
 
 		 239 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  86.34 
 
 		 240 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  91.16 
 
 		 232 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  91.12 
 
 		 234 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  91.04 
 
 		 238 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  91.51 
 
 		 238 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  91.04 
 
 		 238 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  86.61 
 
 		 241 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  83.04 
 
 		 240 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  58.26 
 
 		 231 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  61.01 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  58.06 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  56.22 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  53.7 
 
 		 258 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  53.08 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  54.13 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 220 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 220 aa  207  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  51.43 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  50 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  50.95 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  48.77 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  41.11 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 219 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>