More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2161 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  53.18 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  53.17 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  47.35 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  39.62 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  32.24 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 272 aa  78.2  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>