More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0958 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  40.89 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  43.37 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  24.63 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 293 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.57 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  25.23 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.8 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.83 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  27.64 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.8 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  26.74 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1173  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>