More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3552 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  32.55 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4996  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  30.62 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1173  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  28.02 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  28.57 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  30.24 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>