More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.2 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  29.49 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  21.63 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  27.61 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  29.33 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  32.11 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  28.14 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  29.33 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4996  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>