More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2036 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 213 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  58.96 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  55.92 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3337  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0218222  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.3 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  29.7 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 346 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  25.82 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.23 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0240  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  26.79 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>