More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0606 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 346 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 262 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 244 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  29.61 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 265 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  29.08 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.73 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>