More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2728 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 218 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  55.92 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  58.96 
 
 		 213 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3337  transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0218222  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  28.19 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.49 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  31.19 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.21 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.08 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.14 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  25.33 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>