More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1921 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 213 aa  423  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  45.19 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  45.67 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 262 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  39.01 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 235 aa  84.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 293 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3471  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.68 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4996  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  29.96 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5261  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  36.28 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  29.06 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.52 
 
 		 264 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  32.29 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 253 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>