More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0726 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  93.83 
 
 		 228 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6608  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0123942 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6206  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00935659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 		 213 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0695  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.02 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.43 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  29.19 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.7 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.83 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>