More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5261 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5261  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0617  transcriptional regulator, GntR family  69.81 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 265 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  29.47 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  33.09 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 290 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  26.73 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  27.54 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  26.57 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  30.61 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>