More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0617 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0617  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5261  transcriptional regulator, GntR family  69.81 
 
 		 212 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 265 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  25.76 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.55 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  26.79 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 235 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  31.58 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>