More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3953 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  32.5 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.28 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.84 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5261  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  29.65 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  36.08 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  25.64 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  35.07 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  23.41 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  34.31 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0223  transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  28.09 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>