More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3951 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  39.3 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  44.95 
 
 		 128 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.13 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  29.55 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.74 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  28.89 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.21 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  30.73 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4418  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.494465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 396 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>