More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5832 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 226 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  35.82 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  44.21 
 
 		 128 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.14 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  30.26 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>