161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0180 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 128 aa  250  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  99.04 
 
 		 208 aa  199  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 259 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 226 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 227 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  32.89 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 236 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  30.43 
 
 		 214 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 241 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  33.75 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 273 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 262 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 232 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  27.78 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 312 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  29.31 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  29.11 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  27.78 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 290 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.75 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 230 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30 
 
 		 222 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  36.67 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  29.11 
 
 		 237 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 252 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 		 262 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 252 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 230 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  25.97 
 
 		 231 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2693  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4615  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 254 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 229 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 235 aa  42.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 271 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 240 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3853  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000435819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2647  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.895609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>