More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4615 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4615  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4629  GntR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 221 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.470716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0223  transcriptional regulator, GntR family  58.96 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0229  GntR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  30.39 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.66 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  29.7 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  36.54 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  29.14 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.14 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>