More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1312 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  56.8 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  35.27 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  32.95 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  29.25 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  38.94 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  30.89 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  30.52 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.17 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  27.05 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.32 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>