More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4561 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
259 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
226 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
226 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  37.31 
 
 
208 aa  118  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
234 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
235 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
254 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  39.6 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  27.98 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  31.96 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  28.43 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  27.19 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
219 aa  72  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  29.74 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  29.5 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  30.93 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  26.06 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  27.48 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>