More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3759 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  62.63 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  34.67 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  32.85 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  35.14 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  28.49 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  26.56 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  33.58 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  26.82 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>