More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0173 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0173  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189463  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0180  regulatory protein GntR, HTH  99.04 
 
 		 128 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1312  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3953  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  30.21 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  24.51 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  26.4 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  22.17 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 232 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  31.15 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5742  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  28.91 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  26.62 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3833  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.644681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  22.65 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  28.79 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>