More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5376 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  80.73 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  79.19 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  59.62 
 
 		 222 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  60.29 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 		 226 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 222 aa  254  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  58.96 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  51.21 
 
 		 245 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  49.27 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  46.31 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  41.71 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  41.75 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  39.41 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.91 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 240 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  30.14 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  32.1 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  36 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  39.17 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  41.05 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  35.66 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  30.72 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>