More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0311 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  387  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  71.43 
 
 		 207 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  45.69 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  41.38 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  34.95 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0561  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.818378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  33.12 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 242 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 242 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  28.36 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3469  transcriptional regulator, GntR family  41.12 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  27.45 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  31.66 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  37.25 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  24.52 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  30.94 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>