More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2798 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  36.57 
 
 		 227 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  33.99 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  33.98 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  34.01 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  31.36 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  32.26 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  31.5 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  26.04 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2161  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111337  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  32.96 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2008  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>