More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3560 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  51.98 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 194 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  49.75 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  46.33 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  43.84 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  42.51 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  45.33 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  42.06 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  41.71 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  43.28 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  41.5 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  36.74 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  35.14 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  37.81 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  38.96 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  25.6 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.05 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  26.29 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3189  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.7 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5125  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>