More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6997 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  51.98 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  50.24 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  53.77 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  53.59 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  44.33 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 194 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  43.11 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  45.81 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  39.25 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  45.6 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  43.96 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  39.41 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  36.63 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  33.33 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2850  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452612  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0727  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  28.74 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  30.67 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  28.66 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  31.88 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  30.43 
 
 		 245 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  24.24 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1118  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.232597  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1038  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>