More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2447 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  80.63 
 
 		 222 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  79.15 
 
 		 226 aa  348  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  76.28 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  70.23 
 
 		 224 aa  308  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  62.56 
 
 		 232 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  61.72 
 
 		 224 aa  274  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  60.1 
 
 		 249 aa  264  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  59.62 
 
 		 221 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  61.43 
 
 		 221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  52.31 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  51.18 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  47.76 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  47.29 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  43.54 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 194 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  45.05 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  42.99 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  41 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.01 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  35.76 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  35.1 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  31.48 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 396 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.33 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>