More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2360 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  53.53 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.3 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 216 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  26.32 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.26 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>