More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4700 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  36.81 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  31.79 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  34.81 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  29.52 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 211 aa  72  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  42 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  27.98 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.9 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  37.42 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  42.39 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>