More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0491 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  51.03 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  50.68 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  33.78 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  26.73 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  26.67 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  26.94 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  24.75 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  23.5 
 
 		 214 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  24.75 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3951  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  28.02 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  25.33 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5832  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>