More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0161 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  94.98 
 
 		 299 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  68.15 
 
 		 292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  51.03 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  39.53 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  33.46 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  33.46 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  32.36 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  41.71 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  29.94 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  25.88 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  24.89 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.45 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  27 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  23.77 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  27.83 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  24.06 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  29 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  27.98 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  24.4 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>