217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4588 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  631  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  99.34 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  99.34 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  99.34 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  99.01 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  98.68 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  88.49 
 
 		 304 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  88.37 
 
 		 304 aa  564  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  71.14 
 
 		 301 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  33.09 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  33.46 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  30.85 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.8 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 219 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  23.87 
 
 		 224 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 219 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  27.54 
 
 		 205 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 233 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  26.19 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5467  transcriptional regulator, GntR family  22.62 
 
 		 225 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660908  normal  0.362752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  26.58 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 297 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 229 aa  48.9  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2317  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 216 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0600206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  21.92 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  24.62 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  25.87 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5197  transcriptional regulator, GntR family  23.85 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477284  normal  0.133192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  26.22 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  24.34 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 228 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>