More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5197 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5197  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477284  normal  0.133192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5467  transcriptional regulator, GntR family  96.8 
 
 		 225 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660908  normal  0.362752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0360  GntR family transcriptional regulator  61.47 
 
 		 220 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2210  GntR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 236 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5699  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417067  normal  0.240474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  24.42 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  22.17 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  22.82 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  23 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  24.42 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  24.27 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  23.26 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  24.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  24.21 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>