More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0360 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0360  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200246  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5467  transcriptional regulator, GntR family  62.39 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660908  normal  0.362752 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5197  transcriptional regulator, GntR family  61.47 
 
 		 219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477284  normal  0.133192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2210  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5699  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417067  normal  0.240474 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  25.24 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  31.31 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  25.35 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  24.4 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  23.56 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  23.08 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  24.43 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  25.36 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  24.76 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  24.15 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  24.66 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  24.76 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  25.14 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  23.27 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  22.9 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  21.66 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  23.66 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.83 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  23.15 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  24.59 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  22.64 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  20.09 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  25.95 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  24.5 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  23.56 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>