229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2161 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  603  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  90.95 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 292 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  39.2 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  28.57 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  27.88 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.21 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  24.61 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 222 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 240 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  28.64 
 
 		 239 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  26.34 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  28.5 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  21.15 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1958  GntR domain protein  27.59 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  28.16 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 203 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  37.14 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 221 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 222 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  25.94 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3006  regulatory protein GntR, HTH  30.25 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  24.15 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31340  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  23.15 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>