More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0285 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 		 300 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 		 300 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  43.73 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  43.39 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 311 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  39.12 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  37.76 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  33.11 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  33.44 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  41.62 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.82 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.19 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  26.36 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 216 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  26.67 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  29.21 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  31.28 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  24.76 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>