More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1607 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  99 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 		 300 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  44.07 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  44.11 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  40.48 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  33.22 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  33.22 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  41.86 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 238 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  31.96 
 
 		 227 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.44 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.17 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  32.95 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  30 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  30 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  30 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  30 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  30 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>