73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3171 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  90.95 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  41.71 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  41.8 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  37.14 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30.5 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  23.2 
 
 		 224 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3006  regulatory protein GntR, HTH  29.89 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5061  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000035042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  35.62 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  41.07 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 232 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 223 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 227 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 218 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 219 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  32.98 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  42.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 222 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 223 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>