More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0261 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  99 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 		 300 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  44.85 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  43.73 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  40.82 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  37.33 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  33.22 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  33.22 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  41.86 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.3 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  31.44 
 
 		 227 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.17 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  29.5 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  29.5 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  29.5 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  29.5 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  32.66 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>