217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1408 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  71.81 
 
 		 304 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  71.81 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  71.81 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  71.81 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  71.14 
 
 		 304 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0066  transcriptional regulator, GntR family  71 
 
 		 304 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  70 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2161  GntR domain-containing protein  34.43 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1607  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0261  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3171  regulatory protein GntR, HTH  29.52 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  24.89 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  24.67 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2846  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  26.87 
 
 		 227 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 233 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  24.39 
 
 		 233 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  24.24 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1708  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  24.31 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  23.65 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  21.79 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  26.73 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  24.63 
 
 		 216 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  24.77 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  24.3 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 228 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 239 aa  49.3  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 322 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 224 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  22.43 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2253  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218359  normal  0.132912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>