222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1603 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 323 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  40.39 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  32.19 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  24.35 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  46.88 
 
 		 236 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0611  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600848  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  50.91 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 248 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 257 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  46.97 
 
 		 240 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  24.19 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0156  transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110293  normal  0.0240706 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  40.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 239 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  48.28 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  29.45 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 157 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  48.98 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 254 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  48.39 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 230 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 242 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  23.04 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  36.49 
 
 		 227 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 226 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  22.07 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  46.55 
 
 		 228 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  46.55 
 
 		 230 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  40.62 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  42.03 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0285  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>